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Es muy importante la organización del código dentro de un programa, al empezar a programar se tiende a crear todo el programa en un mismo fichero y no reutilizar código o también a veces que se crean muchos ficheros distintos que podrían estar más agrupados para facilitar la comprensión de la estructura del programa.
Es importante estudiarse el programa y observar si un código se repetirá en distintos lugares para poder crear una función y de esta manera no escribir el mismo código varias veces. Esto además de reducir el tamaño del código facilita el mantenimiento del programa al tener solo una función que revisar.
Si tenemos funciones muy genéricas como por ejemplo la conexión a la base de datos, funciones que nos calculan fechas, etc. y que pueden ser útiles en distintos programas lo ideal es tenerlas en un fichero aparte y llamarlas cuando las necesitemos. Para ello primero cargaremos el fichero con un include y después llamaremos a la función.
Es aconsejable tener los menús, cabeceras y pies de página en ficheros separados ya que serán comunes en casi todas las partes de la web.
Es útil un fichero de configuración donde tener valores predefinidos de la web, como puede ser el titulo, colores, logos, textos en distintos idiomas, etc.
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